開業以来、商売は順調でしたが、その増収は税務署の目にとまります。当時の課税の仕組みから、大抵の商人は実際の売上高よりも少なく申告し、税務署もそれを見越して上乗せ課税することが慣例となっていました。しかし、創業者 相馬愛蔵・黒光夫妻は売上高をそのまま正直に申告したため、税務署の徴収は中村屋にとって苛酷なものとなってしまいます。

　そこで、夫妻は「売上を増やす他に道はない」と考え、支店を出す決心をします。まず有望とみられる地域（大久保の新開地や千駄ヶ谷方面）に従業員を行商に出し大きな売上があがります。
しかし夫妻は自分の目でも確かめたいと、千駄ヶ谷から今の新宿あたりまでを視察します。そこで愛蔵が目をつけたのが“新宿”でした。
「将来の発展の上から市内電車の終点以外に適地はない」（『一商人として』相馬愛蔵著）と判断し、行商で得られたお得意様の数よりも、将来性で判断したのです。当時の新宿は、まだみすぼらしい街でした。「殺風景で街の裏手に入れば野便所があり、筋向かいの豆腐屋のブリキ屋根が風にあおられてバタバタと音をたてている」（同上）そんなすさんだ雰囲気の場末でした。「でも、それは新宿の外形であって、もうその土地には隆興の気運が眼に見えぬうちに萌していた」（同上）と愛蔵は当時を振り返り語っています。

　新宿移転により中村屋の経営は新しい局面を迎えます。製造場所が広くなったこと、また、売上の平均化を図り経営の効率を上げるため、和菓子の製造販売を開始します。パン屋の和菓子をお客様に評価していただくため「材料の精選」に徹する必要があると考えた愛蔵は、上等のもち米を使った賃餅を廉価で売り出します。お客様から中村屋の商品は「材料を精選した優良品である」ことが認められ、和菓子の売上を後押ししました。